MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. YI23 plasmid byi_1p

Total Repeats: 44196

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016626	AAC	2	6	678	683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377810594
2	NC_016626	GC	3	6	689	694	0 %	0 %	50 %	50 %	377810594
3	NC_016626	ATC	2	6	705	710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377810594
4	NC_016626	CCG	2	6	715	720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377810594
5	NC_016626	TCGA	2	8	738	745	25 %	25 %	25 %	25 %	377810594
6	NC_016626	GAA	2	6	752	757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377810594
7	NC_016626	TTC	2	6	758	763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377810594
8	NC_016626	CAT	2	6	788	793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377810594
9	NC_016626	CACGC	2	10	845	854	20 %	0 %	20 %	60 %	377810594
10	NC_016626	TCG	2	6	888	893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810594
11	NC_016626	GAT	2	6	902	907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377810594
12	NC_016626	GCG	2	6	910	915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810594
13	NC_016626	CAA	2	6	977	982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377810594
14	NC_016626	TTTG	2	8	1015	1022	0 %	75 %	25 %	0 %	377810594
15	NC_016626	TGA	2	6	1077	1082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377810594
16	NC_016626	GTGC	2	8	1168	1175	0 %	25 %	50 %	25 %	377810594
17	NC_016626	GGC	2	6	1378	1383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810594
18	NC_016626	CTT	2	6	1427	1432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377810594
19	NC_016626	C	6	6	1514	1519	0 %	0 %	0 %	100 %	377810594
20	NC_016626	ACG	2	6	1786	1791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810595
21	NC_016626	TCA	2	6	2266	2271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377810596
22	NC_016626	GCT	2	6	2333	2338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810596
23	NC_016626	CGAAG	2	10	2369	2378	40 %	0 %	40 %	20 %	377810596
24	NC_016626	AGG	2	6	2384	2389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377810596
25	NC_016626	GCG	2	6	2418	2423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810596
26	NC_016626	GCA	2	6	2468	2473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810596
27	NC_016626	GCG	2	6	2496	2501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810596
28	NC_016626	GCG	2	6	2553	2558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810596
29	NC_016626	GTC	2	6	2564	2569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810596
30	NC_016626	GAG	2	6	2581	2586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377810596
31	NC_016626	GCT	2	6	2612	2617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810596
32	NC_016626	TCT	2	6	2632	2637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377810596
33	NC_016626	TGC	2	6	2644	2649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810596
34	NC_016626	CGT	2	6	2673	2678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810596
35	NC_016626	GCC	2	6	2710	2715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377810596
36	NC_016626	ATCGG	2	10	2743	2752	20 %	20 %	40 %	20 %	377810596
37	NC_016626	GCA	2	6	2753	2758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810596
38	NC_016626	CGG	2	6	2794	2799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810596
39	NC_016626	GGC	2	6	2804	2809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810596
40	NC_016626	GCG	2	6	2823	2828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810596
41	NC_016626	CAG	2	6	2830	2835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810596
42	NC_016626	GAC	2	6	2948	2953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810596
43	NC_016626	GC	3	6	2991	2996	0 %	0 %	50 %	50 %	377810596
44	NC_016626	GGA	2	6	3107	3112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377810596
45	NC_016626	GCAC	2	8	3163	3170	25 %	0 %	25 %	50 %	377810596
46	NC_016626	TGC	2	6	3334	3339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810597
47	NC_016626	TTC	2	6	3342	3347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377810597
48	NC_016626	CGA	2	6	3349	3354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810597
49	NC_016626	TGGT	2	8	3570	3577	0 %	50 %	50 %	0 %	377810597
50	NC_016626	TGG	2	6	3688	3693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377810597
51	NC_016626	TGC	2	6	3709	3714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810597
52	NC_016626	GGA	2	6	3728	3733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377810597
53	NC_016626	TCT	2	6	3829	3834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377810597
54	NC_016626	TGG	2	6	3856	3861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377810597
55	NC_016626	GCG	2	6	3886	3891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810597
56	NC_016626	TCG	2	6	3958	3963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810597
57	NC_016626	TC	3	6	3970	3975	0 %	50 %	0 %	50 %	377810597
58	NC_016626	CTG	2	6	4014	4019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810597
59	NC_016626	CGC	2	6	4024	4029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377810597
60	NC_016626	GAT	2	6	4034	4039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377810597
61	NC_016626	GGCT	2	8	4122	4129	0 %	25 %	50 %	25 %	377810597
62	NC_016626	CCG	2	6	4149	4154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377810597
63	NC_016626	GCCG	2	8	5973	5980	0 %	0 %	50 %	50 %	377810598
64	NC_016626	CG	3	6	5991	5996	0 %	0 %	50 %	50 %	377810598
65	NC_016626	TCTGT	2	10	6051	6060	0 %	60 %	20 %	20 %	377810598
66	NC_016626	GGC	2	6	6144	6149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810598
67	NC_016626	GCCGG	2	10	6225	6234	0 %	0 %	60 %	40 %	377810598
68	NC_016626	GTC	2	6	6237	6242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810598
69	NC_016626	GAC	2	6	6243	6248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810598
70	NC_016626	GCCG	2	8	6271	6278	0 %	0 %	50 %	50 %	377810598
71	NC_016626	TG	3	6	6326	6331	0 %	50 %	50 %	0 %	377810598
72	NC_016626	CGA	2	6	6503	6508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810599
73	NC_016626	CGC	2	6	6602	6607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377810599
74	NC_016626	AGC	3	9	6634	6642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810599
75	NC_016626	CG	3	6	6652	6657	0 %	0 %	50 %	50 %	377810599
76	NC_016626	GAC	2	6	6711	6716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810599
77	NC_016626	GGT	2	6	6746	6751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377810599
78	NC_016626	GC	3	6	6770	6775	0 %	0 %	50 %	50 %	377810599
79	NC_016626	TGC	2	6	6781	6786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810599
80	NC_016626	GCA	2	6	6794	6799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810599
81	NC_016626	CGC	2	6	6812	6817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377810599
82	NC_016626	GAG	2	6	6828	6833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377810599
83	NC_016626	C	6	6	6952	6957	0 %	0 %	0 %	100 %	377810599
84	NC_016626	CGG	3	9	6976	6984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810599
85	NC_016626	TGAT	2	8	7069	7076	25 %	50 %	25 %	0 %	377810599
86	NC_016626	TCT	2	6	7079	7084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377810599
87	NC_016626	CGC	2	6	7132	7137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377810599
88	NC_016626	GCG	2	6	7164	7169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810599
89	NC_016626	CTG	2	6	7275	7280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810599
90	NC_016626	TCG	2	6	7351	7356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810599
91	NC_016626	CGAA	2	8	7360	7367	50 %	0 %	25 %	25 %	377810599
92	NC_016626	CGT	2	6	7450	7455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810599
93	NC_016626	CGG	2	6	7576	7581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810599
94	NC_016626	CGC	2	6	8160	8165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377810600
95	NC_016626	GAGC	2	8	8181	8188	25 %	0 %	50 %	25 %	377810600
96	NC_016626	GCA	2	6	8229	8234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810600
97	NC_016626	GTC	2	6	8293	8298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810600
98	NC_016626	TGC	2	6	8303	8308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810600
99	NC_016626	CTG	2	6	8338	8343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810600
100	NC_016626	GC	4	8	8421	8428	0 %	0 %	50 %	50 %	377810600
101	NC_016626	CTG	2	6	8551	8556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810600
102	NC_016626	CGG	2	6	8702	8707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810600
103	NC_016626	GAA	3	9	8725	8733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377810600
104	NC_016626	ACT	2	6	8757	8762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377810600
105	NC_016626	CAA	2	6	8790	8795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377810600
106	NC_016626	GATC	2	8	8856	8863	25 %	25 %	25 %	25 %	377810600
107	NC_016626	ACG	2	6	8912	8917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810600
108	NC_016626	GTG	2	6	8932	8937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377810600
109	NC_016626	TGC	2	6	8958	8963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810600
110	NC_016626	ACC	2	6	9013	9018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377810600
111	NC_016626	CGA	2	6	9024	9029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810600
112	NC_016626	AGA	2	6	9030	9035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377810600
113	NC_016626	TGCGT	2	10	9068	9077	0 %	40 %	40 %	20 %	377810600
114	NC_016626	GC	3	6	9161	9166	0 %	0 %	50 %	50 %	377810600
115	NC_016626	CA	4	8	9189	9196	50 %	0 %	0 %	50 %	377810600
116	NC_016626	CGC	2	6	9350	9355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377810600
117	NC_016626	TGG	2	6	9374	9379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377810600
118	NC_016626	GGT	2	6	9516	9521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377810600
119	NC_016626	GAG	2	6	9568	9573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377810600
120	NC_016626	GCT	2	6	9707	9712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810601
121	NC_016626	GAA	2	6	9754	9759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377810601
122	NC_016626	CGCT	2	8	9802	9809	0 %	25 %	25 %	50 %	377810601
123	NC_016626	CGT	2	6	9824	9829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810601
124	NC_016626	GCTG	2	8	9860	9867	0 %	25 %	50 %	25 %	377810601
125	NC_016626	TCC	2	6	9901	9906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	377810601
126	NC_016626	CGG	3	9	9920	9928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810601
127	NC_016626	CG	3	6	10028	10033	0 %	0 %	50 %	50 %	377810601
128	NC_016626	ATC	2	6	10086	10091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377810601
129	NC_016626	TGA	2	6	10094	10099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377810601
130	NC_016626	TC	3	6	10100	10105	0 %	50 %	0 %	50 %	377810601
131	NC_016626	TCT	2	6	10178	10183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377810601
132	NC_016626	CCAA	2	8	10192	10199	50 %	0 %	0 %	50 %	377810601
133	NC_016626	CTGG	2	8	10207	10214	0 %	25 %	50 %	25 %	377810601
134	NC_016626	ACG	2	6	10216	10221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810601
135	NC_016626	GGC	2	6	10247	10252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810601
136	NC_016626	CGA	2	6	10276	10281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810601
137	NC_016626	CAGC	2	8	10318	10325	25 %	0 %	25 %	50 %	377810601
138	NC_016626	GAGCG	2	10	10370	10379	20 %	0 %	60 %	20 %	377810601
139	NC_016626	ATC	2	6	10741	10746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377810602
140	NC_016626	CAAT	2	8	10772	10779	50 %	25 %	0 %	25 %	377810602
141	NC_016626	GCGA	2	8	10780	10787	25 %	0 %	50 %	25 %	377810602
142	NC_016626	CGT	2	6	10797	10802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810602
143	NC_016626	GAA	2	6	10805	10810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377810602
144	NC_016626	ACG	2	6	10861	10866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810602
145	NC_016626	AGC	2	6	10873	10878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810602
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148	NC_016626	GC	3	6	10926	10931	0 %	0 %	50 %	50 %	377810602
149	NC_016626	CGT	2	6	10961	10966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810602
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153	NC_016626	GCG	2	6	11155	11160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810602
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155	NC_016626	CG	3	6	11181	11186	0 %	0 %	50 %	50 %	377810602
156	NC_016626	TCC	2	6	11221	11226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	377810602
157	NC_016626	CAG	2	6	11280	11285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810602
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159	NC_016626	GCA	2	6	11345	11350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810602
160	NC_016626	GCG	2	6	11358	11363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810602
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163	NC_016626	GGT	2	6	11432	11437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377810602
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165	NC_016626	CGA	2	6	11755	11760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810603
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247	NC_016626	GCC	2	6	15946	15951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377810606
248	NC_016626	CG	5	10	15960	15969	0 %	0 %	50 %	50 %	377810606
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256	NC_016626	GCTC	2	8	16133	16140	0 %	25 %	25 %	50 %	377810606
257	NC_016626	CG	3	6	16162	16167	0 %	0 %	50 %	50 %	377810606
258	NC_016626	CGG	2	6	16181	16186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810606
259	NC_016626	CGA	2	6	16265	16270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810606
260	NC_016626	CG	3	6	16286	16291	0 %	0 %	50 %	50 %	377810606
261	NC_016626	CGC	2	6	16308	16313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377810606
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388	NC_016626	CGAG	2	8	20687	20694	25 %	0 %	50 %	25 %	377810610
389	NC_016626	ACG	2	6	20695	20700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810610
390	NC_016626	ACG	2	6	20707	20712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810610
391	NC_016626	CG	3	6	20832	20837	0 %	0 %	50 %	50 %	377810610
392	NC_016626	TGC	2	6	20878	20883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810610
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422	NC_016626	GAAG	2	8	21778	21785	50 %	0 %	50 %	0 %	377810611
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462	NC_016626	GAT	2	6	23174	23179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377810612
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493	NC_016626	CGG	2	6	26237	26242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810614
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496	NC_016626	CGA	2	6	26291	26296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810614
497	NC_016626	CG	3	6	26300	26305	0 %	0 %	50 %	50 %	377810614
498	NC_016626	TCG	2	6	26323	26328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377810614
499	NC_016626	GCG	2	6	26334	26339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377810614
500	NC_016626	AGC	2	6	26380	26385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377810614

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